切片阅读器 · 使用帮助
界面语言
在“设置 → 界面语言”中选择跟随系统或指定语言。退出并重新打开应用后生效,选择时不会中断当前任务。病例标题和文件名保持原样。数值输入支持当前语言的小数分隔符或英文句点,不使用千位分隔符。CSV 按所选语言导出标题和分组,数值仍使用英文句点便于交换。
快速开始
1. 点击“打开切片…”,选择同一组的多张 KFB 或普通图像,也可选择一个文件夹。文件夹只展开一层。
2. 选择基准切片并建立病例。影像会立即打开;还没配准时各张按原样叠在基准上,可以先看、也可以先手动摆。
3. 点击“开始配准”计算对齐。完成后通过图层可见性与透明度控制查看结果。可在配准过程中离开画布,任务仍在本应用内继续。
试用内置示例
在“帮助”菜单点击“打开合成示例”。示例是程序绘制的模拟纹理,不含真实患者数据,不代表真实病理诊断或临床配准精度。点击“开始配准”体验完整流程。
三种对照
混合:叠加各图层并调整透明度。
卷帘:在画布中拖动分界位置,对照基准和选中的另一张片。
探照窗:移动指针,以圆形窗口查看基准切片。
上下拖动图层改变顺序。按住数字键临时隐藏对应可见图层,松开恢复;按住空格只看基准。
手动对齐
勾选左栏“手动对齐这一张”,即可在画布上拖动选中的叠加层:直接拖动移动,按住 ⌥ 拖动旋转,按住 ⌘ 拖动缩放,都围绕该切片自身中心。方向键平移、逗号句号旋转、方括号缩放,按住 ⇧ 走大步。左栏四个数字是相对配准结果的偏移、旋转与缩放,可直接输入;全部填 0 即回到配准结果。
“保存对齐”把手动摆放写入病例的 manual.json,不改动配准结果本身。“还原这一张”丢弃该切片的手动摆放,回到配准算出的位置;“全部还原”对整个病例执行同样操作。没有配准过的病例,还原即回到刚打开时的样子。手动摆放不改变结构相关分数,该切片在列表中标记为“手动”。
区域细胞统计
打开病例后,点击左栏“区域细胞统计…”或“文件 → 区域细胞统计…”。在独立窗口选择一张切片,使用“徒手圈选”(按住拖动,松开闭合)或“多边形”(逐点点击,双击或回车闭合;退格撤回顶点;Esc 取消),然后点击“开始统计”。同一张切片可以保存多个命名区域,通过区域下拉框切换。
Ki67 模式按染色光密度检测目标,按目标的平均 DAB 分量预分为 A(阳性 / 深色)和 B(阴性 / 浅色);灰度模式按平均光密度分组。阴性是检出的淡染细胞核,不是空白玻璃背景。检测阈值越低,检出的淡染目标越多,但背景也更容易连成块;请结合图中标记调整阈值和最小 / 最大面积。面积筛选始终使用原始像素平方 px²;有扫描标定时,统计面积另以 µm² 显示。点击“重新统计(重置分组)”会按当前参数重新生成结果和自动分组。
默认勾选“相连目标按一个计数”,按选择的 4 / 8 连通性计数,粘连目标算一个。取消勾选后,按目标轮廓寻找中心并自动拆分粘连部分,再对每个检出的个体分别计数、计算面积和判定阴阳性;此时 4 / 8 连通选项不参与计数。图中的白线表示拆分位置,可点击拆分后的每个目标进行分组。自动拆分是对可见个体数量的估计,轮廓不清、重叠严重或形状不规则时可能少分或多分,需结合原片核对,不能恢复完全被遮挡的细胞。改变勾选状态后,点击“重新统计(重置分组)”生效。
面积为区域内检出的目标像素面积,不是完整细胞轮廓面积。拆分线只用于显示,不扣除像素面积;面积筛选和边界排除在拆分后逐个目标应用,因此筛选后总面积可能随计数方式变化。默认包含被区域边界截断的目标,仅计算圈内部分;可勾选“排除触及区域边界的目标”。检测不判断细胞是否属于肿瘤,需自行圈定肿瘤区域并排除非目标细胞。
统计后,点击目标或拖框选择(按目标中心判断),按 ⌘ / ⇧ 可多选;列表也支持多选,双击定位。将所选目标归入 A、B 或“不计入”,可撤销最近 20 次分组操作。比较任意两组时,可先“全部暂不计入”,再分别选择两组加入 A 和 B。橙色标记 A,蓝色标记 B,黄色表示当前选择。
结果显示 A / B 的数量比、面积比,以及 A / (A+B) 的阳性占比;排除目标不进入分母,分母为 0 时显示“—”。多个区域分别统计,重叠区域不会自动去重合并。原始分辨率最适合计数;主动降低分析分辨率可能合并或漏掉小目标。单个区域最多 1600 万分析像素、5 万个目标,超过时需缩小区域或调整设置,不会静默降采样。分析在后台运行,可取消。
区域、参数(包括计数方式)、目标像素几何和人工分组自动保存在病例的 cell-analysis.json,不改动原片。旧版保存的记录仍按相连目标合并计数。“导出全部区域 CSV…”包含各区域的汇总、目标明细、分析参数和计数方式。已有结果以结果下方显示的参数为准,修改设置后须重新统计才会生效。
导航与导出
触控板缩放或滚动、窗口滚动条可改变视野;⌘0 复位。“文件 → 导出当前视野…”保存当前对照的 PNG。“文件 → 导出配准结果…”保存基准坐标下的 JSON。导出图像用于记录与交流,原始文件和配准数据仍保留在病例库。
支持格式
KFB,以及 PNG、JPEG、TIFF、BMP、WebP 中系统 ImageIO 能解码的普通图像。普通 TIFF 仅读取第一帧,不支持把所有 TIFF/SVS/NDPI 视为通用全切片格式。普通图像未设置物理标定,不能用于真实长度测量。不同厂商或版本的 KFB 兼容性应以实际文件验证。
结果与限制
对齐估计平移、旋转和尺度;配不准的地方可以在画布里手动调整。结构相关分数用于发现可能配不上的切片,不是准确率或疾病概率。标记的切片默认隐藏,可人工重新显示检查。
连续切片不是同一层面的组织,局部拉伸、组织缺损和褶皱可能无法对齐。请逐区域核对,不能仅凭叠加结果认定为同一个细胞或作出医疗决定;医疗判断应由合格医务人员完成。
文件移动与恢复
病例引用原文件。若文件移走、磁盘断开或授权失效,打开病例时会提示重新选择同名原文件。请确认选择的确为原文件;若内容已改变,应重新建立病例并配准。
取消与退出
可取消正在运行的配准,保留已经生成的结果。中断的任务在下次启动时尝试继续;文件不可访问时会停止并记入日志。请等待取消完成后再删除病例。
隐私
处理与保存都在本机,应用没有账户和联网功能。完整说明见“帮助 → 隐私政策”。