切片閱讀器 · 使用幫助
界面語言
在“設置 → 界面語言”中選擇跟隨系統或指定語言。退出並重新打開應用後生效,選擇時不會中斷當前任務。病例標題和文件名保持原樣。數值輸入支持當前語言的小數分隔符或英文句點,不使用千位分隔符。CSV 按所選語言導出標題和分組,數值仍使用英文句點便於交換。
快速開始
1. 點擊“打開切片…”,選擇同一組的多張 KFB 或普通圖像,也可選擇一個文件夾。文件夾只展開一層。
2. 選擇基準切片並建立病例。影像會立即打開;還沒配準時各張按原樣疊在基準上,可以先看、也可以先手動擺。
3. 點擊“開始配准”計算對齊。完成後通過圖層可見性與透明度控制查看結果。可在配准過程中離開畫布,任務仍在本應用內繼續。
試用內置示例
在“幫助”菜單點擊“打開合成示例”。示例是程序繪制的模擬紋理,不含真實患者數據,不代表真實病理診斷或臨床配准精度。點擊“開始配准”體驗完整流程。
三種對照
混合:疊加各圖層並調整透明度。
捲簾:在畫布中拖動分界位置,對照基準和選中的另一張片。
探照窗:移動指針,以圓形窗口查看基準切片。
上下拖動圖層改變順序。按住數字鍵臨時隱藏對應可見圖層,松開恢復;按住空格只看基準。
手動對齊
勾選左欄“手動對齊這一張”,即可在畫布上拖動選中的疊加層:直接拖動移動,按住 ⌥ 拖動旋轉,按住 ⌘ 拖動縮放,都圍繞該切片自身中心。方向鍵平移、逗號句號旋轉、方括號縮放,按住 ⇧ 走大步。左欄四個數字是相對配准結果的偏移、旋轉與縮放,可直接輸入;全部填 0 即回到配准結果。
“保存對齊”把手動擺放寫入病例的 manual.json,不改動配准結果本身。“還原這一張”丟棄該切片的手動擺放,回到配准算出的位置;“全部還原”對整個病例執行同樣操作。沒有配准過的病例,還原即回到剛打開時的樣子。手動擺放不改變結構相關分數,該切片在列表中標記為“手動”。
區域細胞統計
打開病例後,點擊左欄“區域細胞統計…”或“文件 → 區域細胞統計…”。在獨立窗口選擇一張切片,使用“徒手圈選”(按住拖動,松開閉合)或“多邊形”(逐點點擊,雙擊或回車閉合;退格撤回頂點;Esc 取消),然後點擊“開始統計”。同一張切片可以保存多個命名區域,通過區域下拉框切換。
Ki67 模式按染色光密度檢測目標,按目標的平均 DAB 分量預分為 A(陽性 / 深色)和 B(陰性 / 淺色);灰度模式按平均光密度分組。陰性是檢出的淡染細胞核,不是空白玻璃背景。檢測閾值越低,檢出的淡染目標越多,但背景也更容易連成塊;請結合圖中標記調整閾值和最小 / 最大面積。面積篩選始終使用原始像素平方 px²;有掃描標定時,統計面積另以 µm² 顯示。點擊“重新統計(重置分組)”會按當前參數重新生成結果和自動分組。
默認勾選“相連目標按一個計數”,按選擇的 4 / 8 連通性計數,粘連目標算一個。取消勾選後,按目標輪廓尋找中心並自動拆分粘連部分,再對每個檢出的個體分別計數、計算面積和判定陰陽性;此時 4 / 8 連通選項不參與計數。圖中的白線表示拆分位置,可點擊拆分後的每個目標進行分組。自動拆分是對可見個體數量的估計,輪廓不清、重疊嚴重或形狀不規則時可能少分或多分,需結合原片核對,不能恢復完全被遮擋的細胞。改變勾選狀態後,點擊“重新統計(重置分組)”生效。
面積為區域內檢出的目標像素面積,不是完整細胞輪廓面積。拆分線只用於顯示,不扣除像素面積;面積篩選和邊界排除在拆分後逐個目標應用,因此篩選後總面積可能隨計數方式變化。默認包含被區域邊界截斷的目標,僅計算圈內部分;可勾選“排除觸及區域邊界的目標”。檢測不判斷細胞是否屬於腫瘤,需自行圈定腫瘤區域並排除非目標細胞。
統計後,點擊目標或拖框選擇(按目標中心判斷),按 ⌘ / ⇧ 可多選;列表也支持多選,雙擊定位。將所選目標歸入 A、B 或“不計入”,可撤銷最近 20 次分組操作。比較任意兩組時,可先“全部暫不計入”,再分別選擇兩組加入 A 和 B。橙色標記 A,藍色標記 B,黃色表示當前選擇。
結果顯示 A / B 的數量比、面積比,以及 A / (A+B) 的陽性佔比;排除目標不進入分母,分母為 0 時顯示“—”。多個區域分別統計,重疊區域不會自動去重合併。原始分辨率最適合計數;主動降低分析分辨率可能合併或漏掉小目標。單個區域最多 1600 萬分析像素、5 萬個目標,超過時需縮小區域或調整設置,不會靜默降採樣。分析在後台運行,可取消。
區域、參數(包括計數方式)、目標像素幾何和人工分組自動保存在病例的 cell-analysis.json,不改動原片。舊版保存的記錄仍按相連目標合併計數。“導出全部區域 CSV…”包含各區域的匯總、目標明細、分析參數和計數方式。已有結果以結果下方顯示的參數為準,修改設置後須重新統計才會生效。
導航與導出
觸控板縮放或滾動、窗口滾動條可改變視野;⌘0 復位。“文件 → 導出當前視野…”保存當前對照的 PNG。“文件 → 導出配准結果…”保存基準坐標下的 JSON。導出圖像用於記錄與交流,原始文件和配准數據仍保留在病例庫。
支持格式
KFB,以及 PNG、JPEG、TIFF、BMP、WebP 中系統 ImageIO 能解碼的普通圖像。普通 TIFF 僅讀取第一幀,不支持把所有 TIFF/SVS/NDPI 視為通用全切片格式。普通圖像未設置物理標定,不能用於真實長度測量。不同廠商或版本的 KFB 兼容性應以實際文件驗證。
結果與限制
對齊估計平移、旋轉和尺度;配不准的地方可以在畫布裡手動調整。結構相關分數用於發現可能配不上的切片,不是準確率或疾病概率。標記的切片默認隱藏,可人工重新顯示檢查。
連續切片不是同一層面的組織,局部拉伸、組織缺損和褶皺可能無法對齊。請逐區域核對,不能僅憑疊加結果認定為同一個細胞或作出醫療決定;醫療判斷應由合格醫務人員完成。
文件移動與恢復
病例引用原文件。若文件移走、磁盤斷開或授權失效,打開病例時會提示重新選擇同名原文件。請確認選擇的確為原文件;若內容已改變,應重新建立病例並配准。
取消與退出
可取消正在運行的配准,保留已經生成的結果。中斷的任務在下次啓動時嘗試繼續;文件不可訪問時會停止並記入日誌。請等待取消完成後再刪除病例。
隱私
處理與保存都在本機,應用沒有賬戶和聯網功能。完整說明見“幫助 → 隱私政策”。